Jones, que llevaba varias semanas jugando con una pequeña fractura en el peroné de la pierna izquierda, se desplomó sobre el césped sujetándose la pierna derecha en una acción sin contacto durante el primer cuarto del partido del domingo.
El jugador de 28 años lanzó el casco al suelo con frustración tras la acción, antes de ser ayudado a salir del campo. Más tarde reapareció en la banda con una bota protectora en la pierna derecha.
El entrenador principal de los Colts, Shane Steichen, ha declarado que la lesión de Jones "podría ser de final de temporada".
"No es seguro, pero no pinta bien," comentó Steichen.
Jones ha sido clave liderando la resurrección de los Colts esta campaña, colocando al equipo en una posición firme para alcanzar los playoffs por primera vez desde la temporada 2020.
La derrota de los Colts el domingo les ha hecho caer al segundo puesto de la AFC Sur con un balance de 8-5, mientras que Jacksonville ha subido al primer lugar con 9-4.