Los visitantes tomaron la iniciativa desde el principio, y Robert Andrich sintió la presión de los Gunners, ya que fue amonestado a los dos minutos por derribar a Viktor Gyökeres.
Christian Kofane generó peligro en el área contraria y ayudó a Die Werkself a meterse en el partido, aunque David Raya detuvo sin problemas el disparo lejano del joven de 19 años y Ibrahim Maza remató desviado tras recibir el pase.
Con el partido más abierto, Gabriel Martinelli estrelló un disparo en el larguero de Janis Blaswich tras una rápida jugada del Arsenal, antes de que Gabriel Magalhães bloqueara con valentía un intento de Jarell Quansah.
En su regreso al club de origen, Piero Hincapié vio cómo su disparo desde un ángulo complicado era detenido, pero con tanto en juego el partido fue más físico que creativo a medida que avanzó la primera parte.
Eso quedó reflejado poco antes del descanso, cuando Exequiel Palacios frenó a Bukayo Saka en su propia área y lanzó a Kofane, que luego fue detenido por Gabriel y William Saliba.
La rutina de saque inicial de Die Werkself permitió que el remate de cabeza de Martin Terrier obligara a Raya a realizar una gran parada, pero nada pudo hacer el portero visitante en el córner posterior, donde Andrich encontró espacio para marcar de cabeza a menos de un minuto de la reanudación.
Hincapié no acertó con su remate de cabeza tras una falta lanzada por Declan Rice en el minuto 60, mientras el Arsenal buscó más opciones con Noni Madueke entrando por Saka tras esa jugada.
Los locales mantuvieron el control durante buena parte del encuentro, incluso cuando Jurriën Timber cabeceó por encima del larguero.
Esa comodidad se desvaneció cuando Malik Tillman cometió penalti al derribar a Madueke, y Havertz transformó desde los 11 metros, igualando la eliminatoria ante el club en el que pasó una década, a pesar de que Blaswich adivinó la dirección del disparo.
Ese gol dejó la eliminatoria completamente abierta de cara a la vuelta. Además, obligó al Leverkusen a conformarse con su cuarto empate consecutivo en todas las competiciones y amplió la racha invicta del Arsenal a 12 partidos.
Flashscore Jugador del Partido: Exequiel Palacios (Bayer Leverkusen)