El uruguayo fue sancionado por hacer un comentario racista sobre su compañero de equipo Son Heung-min.
Bentancur había negado la acusación, pero una comisión reguladora independiente la consideró probada y la FA impuso el mes pasado al jugador de 27 años la suspensión y una multa de 100.000 libras (126.930 dólares).
Los Spurs apelaron entonces, argumentando que la sanción era demasiado "severa".
"Esta apelación fue desestimada tras una audiencia, y la suspensión de siete partidos se mantiene según lo ordenado por la Comisión Reguladora", dijo la FA en un comunicado.
Bentancur se perderá el partido de cuartos de final de la Copa de la Liga contra el Manchester United el jueves y un partido clave de la Premier League contra el Liverpool en casa el domingo.