El jugador argentino disputó la mayor parte de la victoria por 1-0 ante Venezuela en un partido amistoso en Florida el viernes.
Argentina comunicó en X que Enzo Fernandez sufre "sinovitis en la rodilla derecha".
Enzo Fernandez, que ha marcado tres goles en la Premier League para el Chelsea, séptimo en la tabla esta temporada, es el último centrocampista del club en lesionarse. Cole Palmer, Dario Essugo y Andrey Santos también están de baja.
Argentina se enfrentará a Puerto Rico en otro amistoso el martes, mientras que el Chelsea visitará al Nottingham Forest el 18 de octubre.